Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux2P70298 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux2P70298 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux2P70298 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux2P70298 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux2P70298 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux2P70298 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux2P70298 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux2P70298 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux2P70298 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux2P70298 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux2P70298 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux2P70298 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms