Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms