Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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Map3k1P53349 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Map3k1P53349 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Map3k1P53349 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Map3k1P53349 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Map3k1P53349 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Map3k1P53349 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
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Map3k1P53349 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Map3k1P53349 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Map3k1P53349 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms