Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr5P51682 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms