Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FmodP50608 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FmodP50608 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms