Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SftpbP50405 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SftpbP50405 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SftpbP50405 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SftpbP50405 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SftpbP50405 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SftpbP50405 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SftpbP50405 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SftpbP50405 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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