Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcntP48725 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PcntP48725 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcntP48725 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcntP48725 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcntP48725 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcntP48725 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcntP48725 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcntP48725 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcntP48725 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcntP48725 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcntP48725 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcntP48725 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PcntP48725 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcntP48725 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcntP48725 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcntP48725 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcntP48725 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcntP48725 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcntP48725 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcntP48725 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcntP48725 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcntP48725 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PcntP48725 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcntP48725 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcntP48725 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcntP48725 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcntP48725 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcntP48725 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcntP48725 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PcntP48725 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcntP48725 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcntP48725 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcntP48725 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PcntP48725 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcntP48725 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcntP48725 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcntP48725 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcntP48725 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcntP48725 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcntP48725 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcntP48725 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PcntP48725 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcntP48725 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcntP48725 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcntP48725 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms