Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrprbP47758 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrprbP47758 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SrprbP47758 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms