Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cdkn1bP46414 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkn1bP46414 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms