Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Klf1P46099 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms