Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VhlP40338 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VhlP40338 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VhlP40338 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VhlP40338 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VhlP40338 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms