Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Traf2P39429 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Traf2P39429 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Traf2P39429 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Traf2P39429 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Traf2P39429 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Traf2P39429 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf2P39429 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf2P39429 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Traf2P39429 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Traf2P39429 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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