Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TtlP38585 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
TtlP38585 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TtlP38585 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtlP38585 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms