Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprkP35822 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprkP35822 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprkP35822 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprkP35822 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprkP35822 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprkP35822 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprkP35822 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprkP35822 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprkP35822 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprkP35822 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprkP35822 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprkP35822 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms