Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprmP28828 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprmP28828 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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PtprmP28828 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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PtprmP28828 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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PtprmP28828 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PtprmP28828 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PtprmP28828 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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PtprmP28828 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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PtprmP28828 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprmP28828 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
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