Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms