Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nfkb1P25799 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms