Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh1a1P24549 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh1a1P24549 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh1a1P24549 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms