Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prim1P20664 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prim1P20664 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prim1P20664 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms