Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
P20040 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
P20040 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P20040 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P20040 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
P20040 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P20040 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P20040 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P20040 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P20040 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P20040 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P20040 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P20040 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P20040 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P20040 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
P20040 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P20040 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P20040 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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P20040 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P20040 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P20040 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P20040 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P20040 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P20040 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P20040 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P20040 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P20040 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
P20040 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P20040 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P20040 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
P20040 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P20040 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P20040 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P20040 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P20040 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P20040 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
P20040 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
P20040 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P20040 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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P20040 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
P20040 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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P20040 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P20040 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P20040 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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P20040 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P20040 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P20040 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P20040 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P20040 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P20040 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P20040 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P20040 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P20040 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P20040 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P20040 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P20040 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P20040 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P20040 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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