Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NefhP19246 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NefhP19246 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NefhP19246 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NefhP19246 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NefhP19246 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NefhP19246 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NefhP19246 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NefhP19246 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NefhP19246 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NefhP19246 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NefhP19246 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NefhP19246 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NefhP19246 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NefhP19246 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NefhP19246 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NefhP19246 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NefhP19246 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NefhP19246 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NefhP19246 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NefhP19246 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NefhP19246 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NefhP19246 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NefhP19246 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NefhP19246 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms