Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ass1P16460 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ass1P16460 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ass1P16460 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms