Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp53P15975 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp53P15975 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp53P15975 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp53P15975 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms