Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb1P12658 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms