Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcp1P11983 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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