Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms