Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spta1P08032 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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