Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BlmO88700 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BlmO88700 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BlmO88700 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BlmO88700 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BlmO88700 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BlmO88700 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BlmO88700 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BlmO88700 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BlmO88700 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BlmO88700 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BlmO88700 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BlmO88700 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BlmO88700 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BlmO88700 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BlmO88700 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BlmO88700 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BlmO88700 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BlmO88700 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BlmO88700 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BlmO88700 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BlmO88700 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BlmO88700 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BlmO88700 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BlmO88700 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BlmO88700 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BlmO88700 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BlmO88700 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BlmO88700 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BlmO88700 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BlmO88700 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BlmO88700 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BlmO88700 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BlmO88700 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BlmO88700 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BlmO88700 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BlmO88700 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BlmO88700 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BlmO88700 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BlmO88700 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BlmO88700 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BlmO88700 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BlmO88700 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BlmO88700 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BlmO88700 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BlmO88700 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BlmO88700 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BlmO88700 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BlmO88700 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BlmO88700 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BlmO88700 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BlmO88700 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BlmO88700 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BlmO88700 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BlmO88700 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BlmO88700 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BlmO88700 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BlmO88700 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BlmO88700 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BlmO88700 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BlmO88700 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BlmO88700 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BlmO88700 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BlmO88700 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BlmO88700 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BlmO88700 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BlmO88700 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BlmO88700 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BlmO88700 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BlmO88700 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BlmO88700 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BlmO88700 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BlmO88700 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms