Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlkO54988 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SlkO54988 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlkO54988 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlkO54988 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlkO54988 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlkO54988 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlkO54988 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlkO54988 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlkO54988 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlkO54988 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlkO54988 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlkO54988 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlkO54988 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlkO54988 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlkO54988 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlkO54988 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlkO54988 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlkO54988 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlkO54988 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlkO54988 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlkO54988 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SlkO54988 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlkO54988 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlkO54988 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlkO54988 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlkO54988 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlkO54988 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlkO54988 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlkO54988 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SlkO54988 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms