Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Rdh16O54909 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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Rdh16O54909 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Rdh16O54909 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Rdh16O54909 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Rdh16O54909 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Rdh16O54909 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rdh16O54909 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rdh16O54909 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rdh16O54909 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rdh16O54909 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rdh16O54909 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Rdh16O54909 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Rdh16O54909 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rdh16O54909 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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