Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb3O54890 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms