Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cavin1O54724 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cavin1O54724 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cavin1O54724 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cavin1O54724 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cavin1O54724 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cavin1O54724 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cavin1O54724 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cavin1O54724 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cavin1O54724 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cavin1O54724 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cavin1O54724 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cavin1O54724 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cavin1O54724 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cavin1O54724 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cavin1O54724 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cavin1O54724 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cavin1O54724 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms