Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2bO35690 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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