Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Mterf1a-201ENSMUST00000044746 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ColqO35348 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ColqO35348 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ColqO35348 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ColqO35348 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ColqO35348 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ColqO35348 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ColqO35348 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ColqO35348 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ColqO35348 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ColqO35348 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms