Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2888K7N746 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2888K7N746 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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