Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm11236J3QMS7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm11236J3QMS7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11236J3QMS7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm11236J3QMS7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm11236J3QMS7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm11236J3QMS7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm11236J3QMS7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm11236J3QMS7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm11236J3QMS7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm11236J3QMS7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm11236J3QMS7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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