Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20825J3QM67 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
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