Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610008E11RikG3X964 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms