Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm3371F7CQW8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm3371F7CQW8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm3371F7CQW8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm3371F7CQW8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3371F7CQW8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm3371F7CQW8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm3371F7CQW8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm3371F7CQW8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm3371F7CQW8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm3371F7CQW8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm3371F7CQW8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm3371F7CQW8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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