Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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