Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms