Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trappc8E9PWG2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trappc8E9PWG2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms