Protein–RNA interactions for Protein: E9PVU2

4931429L15Rik, RIKEN cDNA 4931429L15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931429L15RikE9PVU2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms