Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim30bE9PVL6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms