Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms