Protein–RNA interactions for Protein: E9PV04

Gm8994, Predicted gene 8994, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8994E9PV04 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8994E9PV04 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8994E9PV04 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms