Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim12cD3Z3L3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms