Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms