Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clrn2B2RVW2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms