Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms